Inhottujärvi kuuluu Karvianjoen vesistöön, ja sijaitsee pääosaltaan Noormarkussa Porissa. Järvi on Karvianjoen vesistön keskusjärvi, ja on ns. bifurkaatiojärvi. Tämä tarkoittaa, että järvellä on kaksi lasku-uomaa. Karvianjoen vesistöalueella on etenkin 1900-luvulla, mutta jo aiemminkin, tehty lukuisia vesistöjärjestelyjä, joissa järviä on laskettu ja puroja ja jokia perattu etenkin viljelymaan kuivattamiseksi. Tämän seurauksena vesistön suurimmista järvistä muun muassa Kynäsjärvi, Karhijärvi, Inhottujärvi ja Isojärvi ovat säännösteltyjä. Inhottujärvi on vetensä laadun puolesta rehevä, humuspitoinen ja matala järvi, joka on vähitellen kasvamassa umpeen.

Umpeenkasvu on järvissä luontaista, mutta esimerkiksi veden pintaa laskemalla ihminen voi nopeuttaa sitä suuresti. Säännöstelyllä lasketussa Inhottujärvessä on tapahtunut juuri näin, ja sitä onkin luonnehdittu olemukseltaan tyypilliseksi lasketuksi järveksi, jolle on tyypillistä pitkälle ulapalle ulottuva kasvusto.

Monen muun umpeen kasvavan järven tavoin Inhottujärvi on tärkeä lintujärvi. Se kuuluu valtioneuvoston vuonna 1982 vahvistamaan valtakunnalliseen lintuvesien suojeluohjelmaan ja myös Natura 2000 -ohjelmaan. Lintujärvenä se luetaan yhdeksi Etelä-Suomen parhaista. Järvellä esiintyviä lintulajeja ovat mm. kaakkuri, mustakurkku-uikku,  kaulushaikara,  laulujoutsen,  uivelo, ruskosuohaukka, kurki, luhtahuitti, liro, kalatiira, mustatiira ja pikkulepinkäinen. Nisäkkäistä esiintyy esim. saukko. Järvityypiltään Inhottujärvi on rehevä osmankäämi-sarpiotyypin järvi.